Prof. Dr. Focks Forschungsschwerpunkt liegt auf der Entwicklung von mathematischen Modellen zur Beschreibung von biochemischen und ökologischen Prozessen. Anwendungen liegen insbesondere in den Bereichen der Umwelt-Risikobewertung von Chemikalien, und in der Bioökonomie, zum Beispiel zur Simulation von Biogasproduktion und industriellen Fermentationsprozessen.
Weiterhin leitet Prof. Focks als geschäftsführender Direktor das interdisziplinäre Forschungszentrum für Umweltsystemforschung.