Was ist openBIS?
openBIS ist eine kostenlose Server-basierte Software für das Management von wissenschaftlichen Daten und Metadaten. Von der ETH Zürich entwickelt, findet man openBIS seit 2021 auch in der Fachgruppe Biologie der Universität Osnabrück.
Drei unabhängige Module der Software ermöglichen:
- Führen eines elektronischen Laborbuches (ELN) zur Dokumentation von Experimenten.
- Verwalten des Laborinventars samt Lagerung (Laborproben, Materialien, Protokolle etc.).
- Verwalten von Daten jeglicher Art (Rohdaten, prozessierte Daten, Jupyter-Notebooks etc.).
Von der Planung eines Experiments bis zur Veröffentlichung liegen alle Ihre Daten auf einem sicheren, zentralen Server und können jederzeit innerhalb des Universitätsnetzwerkes erstellt, bearbeit und geteilt werden.
Weitere Informationen finden Sie auf der openBIS Homepage.
- sicherer, zentraler Server
- persistente IDs
- Backup
- Audit Trail
- Zugriffs- und Rechteverwaltung
- integrierte domänenspezifische Standards
- Daten-Import/Export (jegliches Format)
- Such- und Filterfunktion
- Storage-Manager
- Hierarchy Graph
- Daten-Sharing (Kollaboration)
Weitere Video-Tutorials finden Sie unter UOS openBIS Video-Tutorials.
Hemani, Y., Koch, K., Mendo-Diaz, O., Bachhofner, A., Baffelli, S., & Bleiner, D. (2025). The openBIS Digital Platform for Instrumentation and Data Workflow in the Analytical Laboratory. CHIMIA, 79(1-2), 36-45. https://doi.org/10.2533/chimia.2025.36
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Barillari, C., Ottoz, D. S., Fuentes-Serna, J. M., Ramakrishnan, C., Rinn, B., & Rudolf, F. (2016). openBIS ELN-LIMS: an open-source database for academic laboratories. Bioinformatics (Oxford, England), 32(4), 638–640. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv606
Bauch, A., Adamczyk, I., Buczek, P., Elmer, F. J., Enimanev, K., Glyzewski, P., Kohler, M., Pylak, T., Quandt, A., Ramakrishnan, C., Beisel, C., Malmström, L., Aebersold, R., & Rinn, B. (2011). openBIS: a flexible framework for managing and analyzing complex data in biology research. BMC bioinformatics, 12, 468. https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-468
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